I comitati misti curano l’attuazione degli Accordi bilaterali. Sono composti da rappresentanti della Svizzera e dell’UE e adottano decisioni di concerto unicamente nei casi contemplati dai trattati interessati. Esiste un comitato misto per ciascun accordo bilaterale, tranne per quelli relativi alla fiscalità del risparmio e alle pensioni.
A questi comitati misti spetta il compito di assicurarsi che gli accordi vengano attuati correttamente. Sono incaricati segnatamente di adattare gli accordi - nei limiti delle rispettive competenze - in funzione delle esperienze conseguite durante la fase di attuazione. Essi permettono inoltre di scambiarsi informazioni tra la Svizzera e l’UE e di comporre eventuali controversie. In linea di massima, i comitati misti si riuniscono una volta all’anno.